MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 45407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	T	7	7	427	433	0 %	100 %	0 %	0 %	385836970
2	NC_017492	TGTC	2	8	453	460	0 %	50 %	25 %	25 %	385836970
3	NC_017492	CTTG	2	8	481	488	0 %	50 %	25 %	25 %	385836970
4	NC_017492	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	385836970
5	NC_017492	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836970
6	NC_017492	A	6	6	515	520	100 %	0 %	0 %	0 %	385836970
7	NC_017492	GAT	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836970
8	NC_017492	ATG	2	6	591	596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836970
9	NC_017492	CGT	2	6	617	622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836970
10	NC_017492	AATC	2	8	629	636	50 %	25 %	0 %	25 %	385836970
11	NC_017492	TGA	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836970
12	NC_017492	TTGCTG	2	12	762	773	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385836970
13	NC_017492	TGG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836970
14	NC_017492	ATGC	2	8	842	849	25 %	25 %	25 %	25 %	385836970
15	NC_017492	ACTT	2	8	987	994	25 %	50 %	0 %	25 %	385836970
16	NC_017492	GAT	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836970
17	NC_017492	AAG	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836970
18	NC_017492	ACT	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836970
19	NC_017492	A	6	6	1399	1404	100 %	0 %	0 %	0 %	385836970
20	NC_017492	CAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836970
21	NC_017492	A	8	8	1438	1445	100 %	0 %	0 %	0 %	385836970
22	NC_017492	ATT	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836970
23	NC_017492	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836970
24	NC_017492	TAA	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836971
25	NC_017492	TTGAAG	2	12	1971	1982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836971
26	NC_017492	TCAA	2	8	2021	2028	50 %	25 %	0 %	25 %	385836971
27	NC_017492	ATA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836971
28	NC_017492	TTA	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836971
29	NC_017492	GCT	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836971
30	NC_017492	GTA	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836971
31	NC_017492	TTG	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836971
32	NC_017492	TTC	2	6	2260	2265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836971
33	NC_017492	TGAAAG	2	12	2274	2285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385836971
34	NC_017492	GAAA	2	8	2290	2297	75 %	0 %	25 %	0 %	385836971
35	NC_017492	AGA	2	6	2440	2445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836971
36	NC_017492	ATG	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836971
37	NC_017492	AAG	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836971
38	NC_017492	TCA	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836971
39	NC_017492	TTA	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836971
40	NC_017492	TTGA	2	8	2594	2601	25 %	50 %	25 %	0 %	385836971
41	NC_017492	TGC	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836971
42	NC_017492	CAAC	2	8	2724	2731	50 %	0 %	0 %	50 %	385836971
43	NC_017492	GAA	2	6	2807	2812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836971
44	NC_017492	AAG	2	6	2829	2834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836971
45	NC_017492	TATC	2	8	2844	2851	25 %	50 %	0 %	25 %	385836971
46	NC_017492	TGAT	2	8	2871	2878	25 %	50 %	25 %	0 %	385836971
47	NC_017492	GAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836971
48	NC_017492	GTAC	2	8	2993	3000	25 %	25 %	25 %	25 %	385836971
49	NC_017492	AATT	2	8	3002	3009	50 %	50 %	0 %	0 %	385836971
50	NC_017492	TA	3	6	3123	3128	50 %	50 %	0 %	0 %	385836972
51	NC_017492	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836972
52	NC_017492	GAA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
53	NC_017492	A	7	7	3186	3192	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
54	NC_017492	TAC	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836972
55	NC_017492	CTT	2	6	3216	3221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836972
56	NC_017492	GAAA	2	8	3241	3248	75 %	0 %	25 %	0 %	385836972
57	NC_017492	CAG	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836972
58	NC_017492	AAC	2	6	3312	3317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836972
59	NC_017492	TTA	2	6	3322	3327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836972
60	NC_017492	CAA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836972
61	NC_017492	A	6	6	3416	3421	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
62	NC_017492	CAG	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836972
63	NC_017492	A	7	7	3557	3563	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
64	NC_017492	AAC	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836972
65	NC_017492	CAG	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836972
66	NC_017492	GAA	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
67	NC_017492	TTAT	2	8	3722	3729	25 %	75 %	0 %	0 %	385836972
68	NC_017492	TGT	2	6	3760	3765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836972
69	NC_017492	TGA	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
70	NC_017492	GAT	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
71	NC_017492	AAAT	2	8	3850	3857	75 %	25 %	0 %	0 %	385836972
72	NC_017492	CTT	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836972
73	NC_017492	TTA	2	6	3948	3953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836972
74	NC_017492	TGA	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
75	NC_017492	A	6	6	3960	3965	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
76	NC_017492	AGA	2	6	3979	3984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
77	NC_017492	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
78	NC_017492	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	385836972
79	NC_017492	CAG	2	6	4113	4118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836972
80	NC_017492	GAAA	2	8	4135	4142	75 %	0 %	25 %	0 %	385836972
81	NC_017492	AAG	2	6	4179	4184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
82	NC_017492	T	6	6	4214	4219	0 %	100 %	0 %	0 %	385836972
83	NC_017492	A	8	8	4238	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
84	NC_017492	GAT	2	6	4259	4264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
85	NC_017492	TGA	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
86	NC_017492	AGA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
87	NC_017492	ACT	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836972
88	NC_017492	AAT	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836972
89	NC_017492	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
90	NC_017492	A	7	7	4501	4507	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
91	NC_017492	TTC	2	6	4658	4663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836972
92	NC_017492	T	6	6	4668	4673	0 %	100 %	0 %	0 %	385836972
93	NC_017492	TGA	2	6	4675	4680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
94	NC_017492	ATGTTG	2	12	4758	4769	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385836972
95	NC_017492	TTG	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836972
96	NC_017492	TGA	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
97	NC_017492	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
98	NC_017492	GTCTT	2	10	4976	4985	0 %	60 %	20 %	20 %	385836972
99	NC_017492	AG	3	6	5002	5007	50 %	0 %	50 %	0 %	385836972
100	NC_017492	ATT	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836972
101	NC_017492	TGA	2	6	5089	5094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
102	NC_017492	A	6	6	5094	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
103	NC_017492	A	6	6	5106	5111	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
104	NC_017492	T	6	6	5235	5240	0 %	100 %	0 %	0 %	385836972
105	NC_017492	A	6	6	5286	5291	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
106	NC_017492	AC	3	6	5340	5345	50 %	0 %	0 %	50 %	385836972
107	NC_017492	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836972
108	NC_017492	T	6	6	5491	5496	0 %	100 %	0 %	0 %	385836972
109	NC_017492	GACT	2	8	5527	5534	25 %	25 %	25 %	25 %	385836972
110	NC_017492	CAG	2	6	5538	5543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836972
111	NC_017492	TGA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
112	NC_017492	AAG	2	6	5577	5582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
113	NC_017492	AGA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
114	NC_017492	TGA	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
115	NC_017492	AGT	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
116	NC_017492	TGA	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
117	NC_017492	TATT	2	8	5776	5783	25 %	75 %	0 %	0 %	385836972
118	NC_017492	GAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
119	NC_017492	TCAT	2	8	5857	5864	25 %	50 %	0 %	25 %	385836972
120	NC_017492	ATG	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
121	NC_017492	A	6	6	5946	5951	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
122	NC_017492	TTTA	2	8	5964	5971	25 %	75 %	0 %	0 %	385836972
123	NC_017492	AACC	2	8	5981	5988	50 %	0 %	0 %	50 %	385836972
124	NC_017492	ATG	2	6	6054	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836972
125	NC_017492	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
126	NC_017492	A	6	6	6115	6120	100 %	0 %	0 %	0 %	385836972
127	NC_017492	GAA	3	9	6137	6145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836972
128	NC_017492	CAAT	2	8	6219	6226	50 %	25 %	0 %	25 %	385836972
129	NC_017492	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836972
130	NC_017492	TCAG	2	8	6256	6263	25 %	25 %	25 %	25 %	385836972
131	NC_017492	ATGA	2	8	6329	6336	50 %	25 %	25 %	0 %	385836972
132	NC_017492	AT	3	6	6463	6468	50 %	50 %	0 %	0 %	385836973
133	NC_017492	TTG	2	6	6520	6525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836973
134	NC_017492	A	6	6	6579	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	385836973
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136	NC_017492	TGA	3	9	6647	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836973
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